鄯善县畜牧兽医局重建于2003年2月,鄯善县畜牧兽医局是县人民政府组成部门,负责全县畜牧、兽医、草原各项业务工作。畜牧兽医局下辖畜牧兽医站、动物卫生监督所、草原站、草原监理站、畜禽品种改良站。县畜牧兽医局及下属单位编制总数57名,现有在职干部职工62人。
  2010年以来,鄯善县被评为“牲畜品种改良先进县”和“动物疫病防控工作先进单位”;畜牧兽医局被自治区评为动物体系建设一等奖、科技培训一等奖;县草原监理站2010年被地区评为“先进单位”,2014年荣获自治区“草原生态保护补助奖励机制工作先进单位”荣誉。
  2015年末,鄯善县完成牛羊育肥100.5万头(只),存栏牲畜31.3万头(只),其中,牛0.47万头,羊29.05万只,猪1.08万头。实现全年出栏羊36万只,出栏牛1.2万头,出栏生猪2.1万头,出栏家禽38.4万羽,肉类总产量12070吨,奶产量662吨,禽蛋产量269吨。多胎能繁母羊饲养量为6.11万只,牛羊自繁自育32.09万头只,黄牛冷配1537头,发展吐鲁番黑羊1.285万只,发展吐鲁番驴5100头,发展斗鸡3.185万羽,发展土鸡41.36万羽。引进良种羊9050只,其中,小尾寒羊6650只,湖羊400只,多浪羊2000只;肉羊杂交改良9516只。完成饲草种植4.039万亩,实现畜牧业总收入42432万元,农牧民人均畜牧业增加收入1491元,人均畜牧业收入较上年增加170元。
  2016年以加快转变畜牧业发展方式为主线,以畜牧业增效、农民增收为目标,着力推进畜牧业转型升级;以发展高效、优质、高产、生态、安全畜牧业为重点,狠抓动物防疫和畜产品质量安全监管,深入开展畜禽品种改良工作,切实加大饲草种植和标准规模化养殖小区建设工作力度,强力推进畜牧产业化进程,使全县畜牧业保持健康发展的良好态势。
  2016年,预计牲畜年末存栏32万头(只),牛羊育肥计划完成100万头(只),饲草种植3万亩、扶贫鸡发展55万羽、斗鸡发展4.5万羽、吐鲁番黑羊发展1万只、吐鲁番驴发展0.5万头,畜牧业人均增收占农牧民人均增收的10%。积极开展美丽乡村创建工作,建设小户集中连片养殖场14个(鲁克沁镇赛尔克甫村3个、三个桥村2个、吐峪沟乡吐峪沟村2个、潘碱坎村2个、迪坎乡迪坎村5个),多胎肉羊杂交改良计划10万只,黄牛品种改良1500头。